Най-сериозният проблем в дейността на "Фонда за лечение на деца" е закъснението на становищата на външните експерти - стана ясно след проверка назначена от здравното министерство. Проблем е и координацията, която Фондът осъществява с лечебните заведения в чужбина, тъй като офертата, определянето на дата за прием и преглед не може да бъде регулирано от Фонда и е в пряка зависимост от болницата.
От министерството посочват, че представените резултати са само част от проверката. Окончателният доклад ще бъде представен до края на месеца.