Атанас Пеканов е роден в Атина, Гърция през 1991 г. Завършва 91-ва немска езикова гимназия „Проф. Константин Гълъбов“ в София, а след това икономика във Виенския университет по икономика и бизнес и магистратура по икономическа политика в Университетски колеж Лондон.

Работи в Европейската централна банка във Франкфурт, Германия, през 2016 г. От 2017 г. работи в Австрийския институт за икономически изследвания. От 2017 г. е и докторант във Виенския икономически университет.

Член е на Съвета за икономическо и социално развитие към Президента на Република България.

Два пъти е избран за стипендиант на Българската народна банка (2015, 2019). През 2018 г. също е избран за стипендиант на Австрийската икономическа асоциация. Член на Инициативата за млади изследователи на Института за Ново икономическо мислене.

Заема поста заместник министър-председател по управление на европейските средства в първото (12 май - 16 септември 2021 г.) и второто (16 септември - 13 декември 2021 г.) служебно правителство на Стефан Янев и в служебните правителства на Гълъб Донев (2 август 2022 - 6 юни 2023 г.).